Profesor Jerzy Młynarczyk w latach 1953-1961 rozegrał 112 meczów w koszykarskiej reprezentacji Polski, w których zdobył 671 punktów. Wziął udział w czterech turniejach mistrzostw Europy – w 1955 roku w Budapeszcie (5. miejsce), w 1957 roku w Sofii (7.), w 1959 roku w Stambule (6.) oraz w 1961 roku w Belgradzie (9.). Wystąpił także na igrzyskach olimpijskich w Rzymie w 1960 roku, w których biało-czerwoni zajęli siódmą lokatę. O sukcesy klubowe walczył najpierw w barwach Warty Poznań, a następnie Lecha. Z tą drugą drużyną w 1958 roku został mistrzem Polski. W latach 1960-1971 reprezentował natomiast Wybrzeże Gdańsk i z „Korsarzami” w 1970 roku wywalczył srebrny medal mistrzostw Polski.

W latach 1977-1981 był prezydentem Gdańska, a w latach 2001-2005 posłem na Sejm IV kadencji. Do końca życia pełnił funkcję rektora Wyższej Szkoły Administracji i Biznesu im. Eugeniusza Kwiatkowskiego w Gdyni.